Plateforme de Cytométrie et Single Cell Immunobiologie (CSI)
Plateforme de Cytométrie et Single Cell Immunobiologie (CSI)
La plateforme CSI fait partie de l’US61 – ASB de l’Université de Tours. Notre plateforme est spécialisée en cytométrie en flux / tri cellulaire ainsi que dans les nouvelles technologies omiques (protéomique et transcriptomique) à l’échelle de la cellule unique. Ces technologies permettent d’aborder des problématiques de recherche fondamentale, appliquée et clinique dans les domaines de l’immunologie, de l’oncologie, de l’inflammation, des maladies infectieuses et/ou des neurosciences. Cette plateforme est ouverte à la communauté scientifique régionale, nationale et internationale, incluant les laboratoires publics ainsi que les entreprises privées.
Liens utiles
Site internet US61 – ASB https://pst-asb.med.univ-tours.fr/
Association Française de Cytométrie (AFC) https://afcytometrie.fr/
Société Française d’Immunologie (SFI) https://immunology.fr/
Pour nous citer:
« Plateforme Cytométrie et Single Cell Immunobiologie, US61 ASB, Université de Tours, CHU Tours, Inserm, Tours, France »
Prestations
- Cytométrie et tri cellulaire
- Analyses protéomique et génomique
- Approches en cellule unique
- Formation des utilisateurs sur les équipements et logiciels
- Prise en charge de l’acquisition et de l’analyse des données
- Conseils aux utilisateurs
- Collaborations scientifiques (aide à la préparation de manuscrits, figures, matériels et méthodes)
Compétences
- Mise en place des approches de single cell (transcriptomique, TCR/BCRseq, ATACseq, CITEseq)
- Nouvelles approches méthodologiques pour le développement d’anticorps issus de patients
- Développement de nouvelles applications en cytométrie en flux et tri cellulaire
Equipement
- 1 trieur cellulaire BD FACS Melody (BD Biosciences) (L2 sous enceinte de protection) : 3 lasers, 9 couleurs, 4 voies de tri
- 1 cytomètre spectral (en cours d’acquisition) : 5 lasers, > 50 détecteurs, > 30 paramètres, passeur de plaques (P96, P384, deep well), rack 40 tubes
- 2 Chromium : Chromium Controller et Chromium X (10X Genomics)
- 1 système Bioplex 200 Biorad (technologie Luminex)
- 1 PSM
- 1 poste d’analyse Flow Jo (PC)
- 1 poste PC Linux
Personnels
- Roxane Lemoine, ingénieure de recherche 100% plateforme
- Christophe Paget, DR Inserm, responsable de la plateforme CSI
- Thomas Baranek, MCU
- Yanis Ramdani, PHU
- Pierre Boulard, AHU
- Valérie Gouilleux-Gruart, MCU-PH
Travaux & Collaborations
- Développement de nouveaux anticorps issus de patients : anticorps anti-SARS-CoV-2 dans la COVID19, anticorps dirigés contre des virus émergents (Zika, encéphalite japonaise, West Nile, Chikungunya) (Inserm U1259), anticorps anti-CMV en transplantation rénale (Inserm U1327), anticorps anti-TRIM21 dans le syndrome Gougerot-Sjögren (INRAe UMR PRC Bios), anticorps anti-Strepto B dans les infections materno-fœtales (INRAe BioMAP et BRMF)
- Rôle des MAIT dans les pneumonies (Pneumocoque et virus de la grippe) (Inserm U1100)
- Rôle des canaux calcique CaV3 et sodique NaV5 dans le cancer colorectal (Inserm U1327)
- Cellules épithéliales bronchiques, macrophages alvéolaires et infection grippale (Inserm U1100)
- Rôle de STING dans la fibrose pulmonaire induite par bléomycine (Inem CNRS Orléans)
- Identification de neutrophiles régulateurs au cours des pneumonies (Inserm U1100)
Publications
9 publications depuis 2022 (JEM, Science Advances, Cell Reports, Virology Journal…)
1 brevet sur les anticorps anti-SARS-CoV-2
