Ces deux équipements à l’interface entre la plateforme génomique de l’US61 et notre plateforme utilisent une technologie de microfluidique en gouttelettes pour isoler chaque cellule dans une microgoutte contenant des billes avec des codes-barres moléculaires uniques. Nous pouvons ainsi préparer des librairies d’ADNc à partir des ARNm contenus dans chaque gouttelette afin de révéler des informations moléculaires et d’analyser des systèmes biologiques complexes.

C’est un outil clé pour la biologie de haute résolution qui permet d’étudier la diversité cellulaire, de caractériser des populations cellulaires rares, de comprendre le développement cellulaire, d’analyser la réponse immunitaire, d’étudier le microenvironnement tumoral, les réponses vaccinales ou inflammatoires…

Les applications sont nombreuses :

• Expression génique à l’échelle de la cellule unique (scRNAseq)
• Analyse des répertoires TCR et BCR des lymphocytes T et B (TCR/BCR-seq)
• Epigénomique et multi-omique avec l’accessibilité de la chromatine (ATAC-seq) et l’analyse combinée ARN + protéine de surface cellulaire (CITE-seq)

Financeur : Contrat Plan Etat-Région

Modalités d’utilisation : Equipement uniquement en prestation avec personnel dédié.