Plateforme d’Infectiologie Expérimentale – PFIE

PIXANIM est une plateforme expérimentale et analytique qui permet l’exploration de l’anatomie, des structures et des fonctions des systèmes biologiques constituant l’animal. Implantée au sein de l’UMR Physiologie de la Reproduction et des Comportements (PRC) sur le Centre INRAE Val de Loire à Nouzilly près de Tours, PIXANIM est sous la triple tutelle d’INRAE, de l’Université de Tours et du CHU de Tours.
Liens utiles
- Site internet bilingue : https://pfie.val-de-loire.hub.inrae.fr/
- Site Institut Carnot F2E : https://www.francefuturelevage.com/qui-sommes-nous#reseau
- Site IBiSA : https://www.ibisa.net/plateformes/plateforme-infectiologie-experimentale-pfie-37.html
- Site Emerg’in : https://www.emergin.fr/content/download/3766/36853?version=5
Pour nous citer:
Dans la partie « Matériels et Méthodes », la PFIE doit être citée comme une infrastructure réalisant des expérimentations validées par un comité d’éthique. Outre les détails mentionnant éventuellement le niveau de confinement et toutes autres informations concernant les conditions d’hébergement des animaux, la citation minimale à faire figurer, sera la suivante, en respectant le libellé relatif à la PFIE : “All experiments were conducted in accordance with the guidelines of the directive 2010/63/EU of the European Parliament and of the Council, in the facilities of the Plate-Forme d’Infectiologie Expérimentale: PFIE, UE-1277, INRAE, Centre Val de Loire, Nouzilly, France (doi: 10.15454/1.5572352821559333E12). All experimental procedures were approved by the Loire Valley ethical review board (CEEA VdL, committee number 19).”
Si vous souhaitez remercier la PFIE dans une publication, nous vous encourageons à citer tous les intervenants de votre protocole. Le format de citation des personnels concernés (UE-1277 PFIE) à utiliser est le suivant : “The authors are grateful to the members of the scientific and animal staff of the Plate-Forme d’Infectiologie Expérimentale: PFIE, UE-1277, INRAE, Centre Val de Loire, Nouzilly, France (doi: 10.15454/1.5572352821559333E12), especially to the study managers*/animal technicians in charge of this study: AAA, BBB and CCC…”. Le chargé d’études (study manager) sera remercié/e, s’il/elle n’est pas associé/e comme co-auteur de la publication.
Prestations
- Accompagnement des scientifiques/clients, en apportant notre expertise en expérimentation animale en milieu confiné, pour la conception des protocoles expérimentaux et la mise en place des démarches administratives et réglementaires nécessaires à leur réalisation ;
- Mise au point de modèles expérimentaux (infectieux, chirurgicaux…) ;
- Mise en œuvre d’études en confinement (niveaux de sécurité biologique 1, 2 et 3) sur animaux de rente, de laboratoire et de la faune sauvage, ainsi que d’analyses complémentaires (hématologie, biochimie, microbiologie…) ;
- Production et la fourniture d’animaux à statut sanitaire et/ou génétique contrôlés et produits d’origine animale pour la recherche.
Compétences
Élevage protégé et expérimentation animale en confinement biologique
Chirurgie et anesthésie en confinement
Prélèvement et analyse (hématologie, biochimie, microbiologie…) d’échantillons contaminés par des pathogènes de niveau de sécurité biologique 1 à 3 (conventionnels ou génétiquement modifiés).
Equipement
Les équipements disponibles sur la plateforme sont :
- Isolateurs volailles avec sas DPTE [Double Porte de Transfert Etanche] (en cours d’acquisition)
- Appareils d’anesthésie gazeuse et de monitoring pour animaux de rente
- Stations d’anesthésie gazeuse pour rongeurs
- Appareils d’euthanasie à CO2 contrôlé
- Appareils d’échographie
- Appareil de fibroscopie/endoscopie et coelioscopie
- Appareils d’analyse biochimique
- Appareils d’analyse hématologique
- Appareil d’imagerie de fluorescence fibrée : Cell vizio®
- Appareil d’imagerie de fluorescence : Fluobeam®
- Appareil d’imagerie de fluorescence pour rongeurs : IVIS Spectrum® en collaboration avec l’UMR ISP
- PSMs
- Equipements pour suivi télémétrique de la température : Anipill®, Biolog ID®, Plexx®
- Balances connectées
- Outils connectés pour rongeurs : balance, identification, pied à coulisse (3 équipements)
- Caméras d’observation en confinement pour rongeurs
- Éclosoirs et incubateurs pour les œufs
Personnels
Personnel spécialisé en élevage protégé, expérimentation animale en confinement et entretien d’installations confinées composé de 43 agents : 24 animaliers, 8 agents de maintenance, 3 gestionnaires et 8 agents d’encadrement (vétérinaires, scientifiques, experts en sécurité biologique, responsable qualité/environnement).
Travaux & Collaborations
Cinq exemples marquants sont cités ci-dessous :
Projet #1 : 2021-2022
Validation de candidats vaccins contre le SARS-CoV-2 dans un modèle de challenge infectieux chez les souris K18-hACE2 et les hamsters dorés
- Coordinateur et laboratoire/institution : Isabelle Dimier-Poisson, INRAE, UMR ISP-Université de Tours – France
- Financement : ANR
- Publication: Lakhrif Z, Poupée-Beaugé A, Boursin F, Ducournau C, Lantier L, Moiré N, Carpentier R, Rossignol C, Maquart M, Jospin F, Mérat L, Caul-Futy M, Yazdanpanah Y, Bouakane A, Riou M, Touzé A, Eléouët JF, Richard CA, Helle F, Le Poder S, Klonjkowski B, Meunier N, Zientara S, Paul S, Mévélec MN, Aubrey N, Epardaud M, Dimier-Poisson I. Intranasal spike and nucleoprotein fusion protein-based vaccine provides cross-protection and reduced transmission against SARS-CoV-2 variants. NPJ Vaccines. 2025, 10(1):75. doi: 10.1038/s41541-025-01123-y.
Résumé : L’objectif de cette étude était d’évaluer l’efficacité d’une stratégie vaccinale muqueuse anti-COVID innovante. Le vaccin candidat a donné d’excellents résultats contre de multiples variants du SARS-CoV-2 dans des modèles de référence précliniques (souris et hamsters), en protégeant contre la maladie et en limitant sa transmission. Actuellement, ce vaccin est en phase I clinique chez l’être humain.
Contribution de la plateforme : Conception d’expériences in vivo (avec le soutien du responsable du projet) et mise en œuvre des modèles basés sur la souris et le hamster. Réalisation des vaccinations, challenges infectieux et suivi clinique dans les 2 modèles animaux en NSB-3. Gestion administrative du dossier : avis éthique / autorisation ministérielle de projet, sécurité biologique, formation du personnel, rédaction et relecture de l’article.
Projet #2 : 2020-2021
Etude des facteurs de virulence associés à l’évolution chronique de l’hépatite E chez les patients immunodéprimés, avec modélisation de l’infection in vivo chez le porc – Projet MODHEP
- Coordinateur scientifique et laboratoire/institution : Denys BRAND, INSERM UMR 1259, Tours – France
- Financement : Financement régional APR-IA (Région Centre Val de Loire)
- Publication: N León-Janampa, I Caballero-Posadas, C Barc, F Darrouzain, A Moreau, T Guinoiseau, P Gatault, I Fleurot, M Riou, A Pinard, J Pezant, C Rossignol, C Gaudy-Graffin, D Brand & J Marle. Un modèle porcin d’hépatite E chronique présentant une virémie persistante et une régulation à la baisse des réponses immunitaires innées dans le foie. Hepatol Commun. 2023;7 : e0274. https://doi.org/10.1097/HC9.0000000000000274
Résumé : Le virus de l’hépatite E (VHE) est un virus zoonotique transmis par la viande de porc et responsable de l’hépatite E chronique chez les patients immunodéprimés. Il s’est avéré difficile de reproduire cette maladie dans son réservoir naturel. Nous avons développé un modèle porcin d’hépatite E chronique qui s’est avéré pertinent pour l’étude de la pathogénie de cette maladie, ainsi que pour la validation de futurs traitements.
Contribution de la plateforme : Conception (avec le support de l’équipe coordinatrice) et mise en œuvre d’expériences in vivo chez le porc. Mise en place d’un modèle animal de porc immunodéprimé (formation puis expérimentation), réalisation des infections en NSB-3 et de leur suivi. Gestion administrative du dossier : analyse des risques biologiques, avis éthique / autorisation ministérielle de projet, mise en forme des résultats et rédaction des rapports, rédaction et relecture de l’article, formation du personnel…
Projet #3 : 2023-2024
Sensibilité de poulets génétiquement modifiés à l’infection par des virus grippaux hautement pathogènes (H7N1)
- Coordinateur scientifique et laboratoire/institution : Hicham Sid, TUM School of Life Sciences – Munich – Allemagne
- Financement : VetBioNet (accès transnational TNA) – EU Horizon 2020
- Publication: H Sid, T von Heyl, S Schleibinger, R Klinger, R Guabiraba, V Guillory, B Schade, D Elleder, S Sives, L Vervelde, S Trapp, B Schusser. La réintégration de RIG-I chez les poulets par modification génétique révèle de nouvelles informations sur l’évolution dynamique des capteurs immunitaires aviaires. BioRXiv https://doi.org/10.1101/2023.11.01.564710
Résumé : Deux facteurs clés de la réponse immunitaire innée antivirale, RIG-I et RNF135, sont absents chez les poulets domestiques mais conservés chez les canards colverts. La perte de RIG-I chez les poulets confère une sensibilité accrue à la grippe aviaire. Dans cette étude, nous avons rétabli ces deux gènes chez les poulets et examiné leur sensibilité au virus de la grippe aviaire H7N1. Les données ont indiqué que la perte de RIG-I chez les poulets a probablement évolué pour contrer l’inflammation délétère causée par l’infection virale.
Contribution de la plateforme : Expérimentations in vivo, dont l’incubation et éclosion des œufs génétiquement modifiés (OGM), élevage des volailles OGM, infection par le virus de la grippe, suivi clinique des animaux et échantillonnage (modèles isolateurs). Gestion administrative : transports, autorisation OGM, avis éthique / autorisation ministérielle de projet, envois des échantillons.
Projet #4 : 2023-2025
Le furet, un modèle animal de choix pour les futurs essais de vaccination contre la tuberculose animale chez la faune sauvage – Projet Fer-TB-VAX
- Coordinateur scientifique et laboratoire/institution : Nathalie Winter, INRAE, UMR ISP-Université de Tours – France
- Financement : Carnot France Future Elevage (F2E)
- Publication: en cours de préparation
Résumé : Ce projet s’inscrit dans un effort global visant à renforcer la vaccination contre la tuberculose. Le furet et le blaireau sont deux espèces de Mustélidés sensibles à Mycobacterium bovis. En tant qu’espèce sauvage, les expérimentations chez le blaireau sont plus contraignantes et le furet représente une alternative plus accessible. Ce projet a abouti à la mise en place d’un nouveau modèle de référence pour l’étude des maladies respiratoires à la PFIE.
Contribution de la plateforme : Gestion de l’ensemble des expérimentations in vivo (mise en place du modèle, conception de solutions d’hébergement adaptées à l’étude et à l’espèce, réalisation d’anesthésies et d’inoculations respiratoires, du suivi zootechnique (télémétrie, température…) et des prélèvements (en NSB-1 et 2). Gestion administrative : dossier d’autorisation OGM, avis éthique / autorisation ministérielle de projet, évaluation et gestion de risques biologiques.
Projet n° 5 : 2023-2028
AVITHRAPID : Thérapies antivirales pour une réponse rapide contre les maladies infectieuses pandémiques.
- Coordinateur scientifique et laboratoire/institution : Björn Windshügel, Institut Fraunhofer-Gesellschaft – Allemagne
- Financement : Fonds européens (HORIZON-HLTH-2023-DISEASE-03-04)
- Publication: projet en cours
Résumé : Le consortium AVITHRAPID (Antiviral Therapeutics for Rapid Response Against Pandemic Infectious Diseases), financé par l’Union européenne, regroupe 18 instituts de recherche et entreprises de 8 pays européens sous la direction de l’institut Fraunhofer-Gesellschaft (Allemagne). Cet instrument vise à développer un portefeuille de nouvelles molécules thérapeutiques antivirales à large spectre contre les virus respiratoires et les arbovirus, rapidement mobilisable en situation d’épidémie ou de pandémie (« Emergency & Prepardness responses to pandemics« ).
Contribution de la plateforme : Gestion de l’ensemble d’expérimentations in vivo dont les essais pré-cliniques (leader du Work-package 2). La PFIE assure la mise en place du modèle hamster/souris (anesthésie et inoculation respiratoire), le suivi zootechnique (télémétrie, température…) et l’échantillonnage en NSB-3.